はい、対応しています。ただし、自動での按分計算はできません。そのつど自身で計算して仕訳をご入力ください。仕訳例は以下のとおりです。

例：現金で支払った家賃8万円のうち、事業用が3万円、個人的な支出が5万円の場合

　　　借方 　　　　　 　貸方
諸口　　　80,000 　現金 　80,000
地代家賃　30,000 　諸口 　30,000
店主貸　　50,000 　諸口 　50,000

なお、フリーウェイ経理の勘定科目の初期設定では「事業主借」「事業主貸」の科目がありません。それぞれ「店主借」「店主貸」の勘定科目をお使いください。

参考：個人事業主の家事按分とは？計算方法や対象の経費を紹介｜株式会社フリーウェイジャパン
参考：Q．科目マスタに「事業主貸」「事業主借」の科目がないので、対処方法を知りたい。