選択肢の違いは以下のとおりです。

▼売掛残高のみ繰越
当年度に登録されている得意先マスタの売掛残高に対し、前年度末時点の売掛残高を上書きします。年次繰越した後に前年度で追加・訂正したマスタ情報は繰越されません。

▼売掛残高とマスタを繰越
前年度末時点の売掛残高に加えて、前年度に登録されているすべてのマスタ情報（基本情報登録を含む）を、当年度に上書きします。前回の年次繰越の後に追加訂正したマスタ情報がある場合は、年次繰越した後に、該当のマスタ情報をご変更ください。