はい、削除できます。

▼解説動画（3分）
https://www.youtube.com/watch?v=lX-ngv7UWtg


▼手順
「データ入力」＞「101 仕訳データ入力」＞データ選択＞月選択（すべてのデータを削除したい場合は「年間入力」を選択）＞仕訳データ表示画面で、一番左側にある最初と最後の行番号を控える＞［F2 追加］または［F3 訂正］＞［F4 削除・復帰］＞「仕訳データ削除」＞控えておいた行番号を指定し［削除］